Στην Υπηρεσία Εναέριων Μέσων του Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής υπάγονται η Μοίρα Αεροπλάνων και η Μοίρα Ελικοπτέρων.
Στην αποστολή της Υπηρεσίας Εναέριων Μέσων Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής περιλαμβάνονται:
- Η αστυνόμευση του ελληνικού θαλάσσιου χώρου και των παράκτιων περιοχών για τη δίωξη της παράνομης αλιείας, αρχαιοκαπηλίας, λαθρεμπορίου, διακίνησης λαθρομεταναστών και κάθε παράνομης πράξης που στοιχειοθετείται και βεβαιώνεται από εναέρια παρατήρηση καθώς και η ενημέρωση των αρμόδιων Υπηρεσιών Δίωξης και η πααροχή οδηγιών στα πλωτά μέσα του Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής για τον εντοπισμό και σύλληψη των παρανομούντων.
- Η επισήμανση περιστατικών θαλάσσιας ρύπανσης, η παροχή στοιχείων στις αρμόδιες Υπηρεσίες και ο συντονισμός των μέσων αντιμετώπισης της ρύπανσης.
- Η συνδρομή για εντοπισμό πλοίων ή ατόμων που κινδυνεύουν στη θαλάσσια περιοχή του FIR Αθηνών σε συνεργασία με τους αρμόδιους φορείς.
- Ο έλεγχος τήρησης των κανονισμών ασφάλειας ναυσιπλοΐας.
- Η συμμετοχή σε ασκήσεις των Ενόπλων Δυνάμεων καθώς επίσης και η συλλογή και παροχή πληροφοριών στις αρμόδιες Υπηρεσίες για κινήσεις πλοίων και σκαφών που σχετίζονται με θέματα εθνικής ασφάλειας.
- Η μεταφορά προσώπων και υλικών, σε περιπτώσεις που η ταχύτητα μετακίνησης, η φύση της αποστολής ή η αδυναμία άλλου μέσου επιβάλλουν την αεροπορική μεταφορά.
- Η διενέργεια αποστολών σε κοινές επιχειρήσεις με με λοιπές συναρμόδιες Αρχές χωρών της Ευρωπαϊκής Ένωσης ή τρίτων χωρών στην αλλοδαπή.
- Η εκτέλεση αποστολών σε θέματα δημόσιας τάξης και κρατικής ασφάλειας.
- Κάθε άλλη αποστολή, στο πλαίσιο των δυνατοτήτων των αεροσκαφών που διαθέτει η Υπηρεσία Εναέριων Μέσων του Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής και ανάγεται στις αρμοδιότητες του Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής ή άλλου κρατικού φορέα.